Concentra a aplicação e desenvolvimento de métodos associados à instrumentação analítica tradicional e não convencional para a garantia da qualidade dos insumos, produtos e coprodutos da cadeia de produção de biocombustíveis. São exploradas técnicas eletroquímicas, espectrofotométricas, cromatográficas, gravimétricas, espectrométricas, bioquímicas e estatísticas para solução de problemas analíticos; tratamento de dados aplicando métodos de inteligência artificial e seleção de variáveis; aplicação de métodos quimiométricos para análise exploratória e classificatória. Também está no escopo desta linha de pesquisa o aproveitamento de coprodutos com vista a agregação de valor, integração de processos, biorrefinaria de lignocelulósicos e gliceroquímica.